期刊简介

  本刊是由中国实验动物学会主办的国家级学术期刊。主要刊载有关实验动物和动物实验的理论专著、科研成果论文、科学实验新方法、新材料、实验动物新资源开发、新的动物品系的培育和应用以及实验动物有关的其他学科的科学论述。读者对象:农牧渔业、医学、药学、环保、生物、体育、国防等单位的科技工作者、管理人员以及有关的生产者、大专院校学生等。


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  • 杂志名称:中国比较医学杂志
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国实验动物学会,中国医学科学院医学实验动物研究所
  • 国际刊号:1671-7856
  • 国内刊号:11-4822/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国科技论文统计源期刊期刊收录:维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 知网收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏
中国比较医学杂志2018年第09期

树鼩大肠内容物细菌的群落多样性分析

郭玉倩;角建林;袁鑫;吴超;王利梅;郑红

关键词:树鼩, 大肠细菌, IlluminaPE250, 多样性
摘要:目的 应用高通量测序技术分析树鼩大肠细菌的结构与组成.方法 采集3只雄性树鼩大肠内容物,用细菌16SrDNA通用引物扩增V3~V4区,采用Illumina PE250平台测序.结果 共获得160157条有效序列,聚类后得437个运算分类单位(operational taxonomic units,OTUs).树鼩大肠中的细菌有9个门、19个纲、37个目、68个科、137个属和194个种.其中,①厚壁菌门和变形菌门的丰度高,分别为63.30%和28.52%;②优势纲是芽孢杆菌纲和γ?变形菌纲(51.46%、28.02%);③乳杆菌目和肠杆菌目的丰度高,为45.33%和27.51%;④优势科是乳杆菌科(35.30%)和肠杆菌科(27.51%);⑤乳杆菌属和埃希氏菌属为优势属(35.30%、27.49%);⑥在种的水平,可培养细菌的丰度为37.10%,未分类细菌27.69%,不可培养细菌35.21%.可培养细菌中,唾液链球菌的丰度高(26.66%).在丰度高的20个种中,8种细菌(40%)未分类,为以往未被发现的新种.个体间细菌群落存在一定差异.结论 树鼩大肠内容物中的细菌组成具有丰富的多样性,其中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的细菌,需要进一步研究.