期刊简介
本刊是由中国实验动物学会主办的国家级学术期刊。主要刊载有关实验动物和动物实验的理论专著、科研成果论文、科学实验新方法、新材料、实验动物新资源开发、新的动物品系的培育和应用以及实验动物有关的其他学科的科学论述。读者对象：农牧渔业、医学、药学、环保、生物、体育、国防等单位的科技工作者、管理人员以及有关的生产者、大专院校学生等。
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首页>中国比较医学杂志
- 杂志名称：中国比较医学杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中国实验动物学会，中国医学科学院医学实验动物研究所
- 国际刊号：1671-7856
- 国内刊号：11-4822/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国科技论文统计源期刊期刊收录：维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 知网收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏
树鼩全基因组分泌蛋白的预测分析
罕园园；马开利
关键词：树鼩, 基因组, 分泌蛋白, 信号肽, 基序
摘要：目的：综合了解树鼩的分泌蛋白的信息。方法利用真核生物分泌蛋白预测流程 EuSecPred 2.0对树鼩的分泌蛋白进行全基因组预测，并对获得的分泌蛋白及所携带的信号肽进行系统分析。结果树鼩全基因组蛋白基因中鉴定获得279个分泌蛋白，占基因组全部编码基因的7.2％。对其功能和结构域进行注释分析，发现了以水解酶类、行使蛋白结合与离子结合功能蛋白质及初级代谢过程相关蛋白为主的分泌蛋白。氨基酸组成分析表明，树鼩分泌蛋白及其信号肽主要由疏水性氨基酸组成，信号肽剪切位点有部分亲水性氨基酸的存在。基序分析发现，分泌蛋白信号肽中未存在保守基序，而分泌蛋白内部存在GxHxCGG[FSV]L[IV][RAS][EP]D[WF] VLTAAHC、[KG]PPGV[YF]T[RK][VI][SC]x[YF][VL][DS]WIQx[TV][MI][RK]、[DT][SA][CF][QK] GDSGGPLVCNGV[LA]QG[IL]V、GY[HL][FL]CGG[SAT]L[ILV]S[EDP][CR]WV[LV][TS]AAHCF、N[IV][FI]FSP[LV]S[IV][SA][TA]ALAMLSLG[AT]xNDTLTQ[IL]L[EQ][GV]LGF[ND]LT[ES]T[SP]E 5种基序。结论在全基因组范围对树鼩分泌蛋白进行预测分析，有助于进一步研究树鼩机体功能调控机制及动物模型的开发。
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