期刊简介
本刊是由中国实验动物学会主办的国家级学术期刊。主要刊载有关实验动物和动物实验的理论专著、科研成果论文、科学实验新方法、新材料、实验动物新资源开发、新的动物品系的培育和应用以及实验动物有关的其他学科的科学论述。读者对象：农牧渔业、医学、药学、环保、生物、体育、国防等单位的科技工作者、管理人员以及有关的生产者、大专院校学生等。
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首页>中国比较医学杂志
- 杂志名称：中国比较医学杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中国实验动物学会，中国医学科学院医学实验动物研究所
- 国际刊号：1671-7856
- 国内刊号：11-4822/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国科技论文统计源期刊期刊收录：维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 知网收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏
小型猪CYP3A88基因克隆与其他动物的序列比较
王世春；桂蓓；商海涛；刘宇；魏泓
关键词：小型猪, CYP3A88, RACE技术, 序列分析
摘要：目的 克隆我国资源小型猪品系巴马香猪肝脏中的CYP3A88基因,并进行生物信息学分析.方法 应用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术对其全长进行扩增,测序,利用Internet和GenBank数据库对其序列进行生物信息学分析.结果首次克隆并鉴定了我国资源小型猪品系巴马香猪肝脏中CYP3A88(GenBank登录号:EF625347)的编码区,获得大小为1965 bp的全长cDNA,编码区长为1512bp,编码503个氨基酸;比较核苷酸序列,与小型猪CYP3A39相似性高达94%,而与人等其它动物的CYP3A相似性则在86%以下;推导和分析氨基酸序列表明,与小型猪CYP3A其它成员(CYP3A39、CYP3A29、CYP3A22)进行对比,其相似性分别为92%,89%,80%,而将小型猪与人的CYP3A分别比对,小型猪CYP3A88与人CYP3A4相似性高,为77%;对其二级结构预测,它可能含12个α螺旋,4个β折叠;经NCBI上的CDD程序分析可知,其39-491氨基酸区域为P450 3A亚家族保守结构区域;经聚类分析,小型猪和狗的CYP3A与人有较近的进化关系;通过同源建模法对其在线建模,人CYP3A4晶体结构作为其模建模型,得到了其经典的三维结构.结论 在猪CYP3A家族四个基因中,CYP3A88在序列和高级结构上均与人CYP3A4的为相似.
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